Translationale Studien und Projekte
Translationale Forschungsstudien (TR), die darauf abzielen, neue Biomarker, Tumorsignaturen oder Tests zu entwickeln, zu überprüfen und zu validieren, gewinnen in der modernen Onkologie zunehmend an Bedeutung. Diese Studien sind oft die Grundlage für neue Diagnoseinstrumente und damit für gezielte und personalisierte Therapien, die in klinischen Studien und in der täglichen klinischen Praxis immer häufiger eingesetzt werden. Die ABCSG ist an zahlreichen translationalen Forschungsprojekten und Kooperationen beteiligt bzw. führt diese federführend durch, da durch den enormen Proben- und Datenschatz aus bisherigen ABCSG-Studien eine wertvolle Ressource für solche Projekte vorliegt.
Das TraX&Vields-Projekt in Zusammenarbeit mit Cepheid ist eines der größten Projekte der ABCSG, da es Arbeitspakete mehrerer ehemaliger Patientenkohorten von ABCSG-Studien umfasst. Im Zentrum all diese Arbeitspakete stehen die Entwicklung und Validierung von zwei Tests: Der Cepheid GeneXpert Breast Cancer STRAT4 stellt ein neues Testverfahren dar, mit dem sich bekannte Tumormarker zuverlässig, reproduzierbar und quantitativ anhand ihrer mRNA-Expressionswerte bestimmen lassen. Dieser Test soll in einer Reihe von Patientenkohorten von ABCSG-Studien validiert werden und hat in einigen Ländern bereits die CE-Zertifizierung erhalten. Weiters soll eine prognostische Brustkrebssignatur zur Bewertung des Rückfallrisikos von Patientinnen mit frühem Brustkrebs entwickelt und validiert werden. Im Jahr 2020 ist eine neue prädiktive Signatur für Brustkrebs (Xpert Insight) in den Fokus gerückt, die ebenfalls in verschiedenen ABCSG-Kohorten validiert werden soll.
An einer Reihe weiterer Cepheid-Arbeitspakete wird parallel geforscht: Für das Projekt Trax&Vields-05 (ABCSG-34-Kohorte) wurden klinische Follow-up-Daten von ehemaligen ABCSG-34-Studienpatientinnen gesammelt. Diese Daten werden zur Validierung einer prognostischen Signatur für Brustkrebs und für weitere Analysen des STRAT4-Tests herangezogen. Alle Laborarbeiten an den im ABCSG Forschungslabor verfügbaren Tumorproben aus dieser Kohorte, wurden finalisiert, und die Validierung der STRAT4-Konkordanzdaten ist ebenfalls bereits abgeschlossen. Die Datenanalyse unter Verwendung der erweiterten klinischen Follow-up-Daten wird der letzte Arbeitsschritt im Rahmen dieser Kohorte sein.
Große Fortschritte wurden im Arbeitspaket TraX&Vields-02 (ABCSG-8) erzielt: Nach Erhalt der regulatorischen Genehmigung wurde im Sommer 2022 mit den Arbeiten im Labor begonnen.
In den Arbeitspaketen, die die ABCSG-12-Kohorte betreffen, werden die ehemaligen ABCSG-12-Studienzentren in die zentrale Erfassung der klinischen Follow-up-Daten der ABCSG-12-Patientinnen und in die zentrale Sammlung der Tumorproben dieser Patientinnen in der ABCSG-Forschungszentrale in Wien eingebunden werden. Anschließend ist die Laboranalyse der gesammelten ABCSG-12-Proben zur Validierung des STRAT4-Tests und die prognostische Signatur geplant.
Im ABCSG TR ProCan-Projekt wird die Proteinexpression analysiert, um eine proteomische Signatur für Fernrezidive bei Hormonrezeptor-positivem (HR+) Brustkrebs im Frühstadium zu entwickeln. Das Children’s Medical Research Institute (CMRI) in Sydney, Australien, ist der Sponsor der Studie und für dieses Projekt werden Proben und HE-gefärbte Tumorschnitte aus der ABCSG-6-Studienkohorte und später auch von den ABCSG-8-Studienpatientinnen zur Verfügung gestellt.
ABCSG TR Artera ist ein digitales Bildgebungsprojekt in Zusammenarbeit mit der US-amerikanischen Firma Artera zur Entwicklung und Evaluierung eines prädiktiven Algorithmus mittels Künstlicher Intelligenz für die maßgeschneiderte Therapiewahl für Brustkrebspatient:innen. In einem ersten Schritt werden für die Trainingskohorte digitalisierte Scans der ABCSG-6- und ABCSG-8- H&E Tumorschnitte erstellt, welche dann die Basis für digitale Pathologie und den Einsatz von „Machine Learning“ sein werden. Anschließend sind auch Validierungen in anderen ABCSG Studienkohorten geplant.
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